汽车起步时有时候咯噔响一声可能有以下几个原因：

1. 离合器起步时有异常声响。这可能是由于离合器内部的分离轴承出现异常摩擦导致的响声。当出现这种情况时，建议检查离合器部件是否老化或损坏，并及时更换损坏的部件。

2. 变速器内部齿轮异常磨损。变速器内部如齿轮的磨损可能会导致起步时的异响。特别是自动挡车辆在城市道路行驶时频繁起步，变速器内部换挡可能会产生异响。对于这种情况，建议检查变速器内部的齿轮，如有必要进行修复或更换损坏的零件。另外要注意日常保养和维护，并按时更换变速箱润滑油。

3. 刹车系统存在问题。例如刹车盘与刹车片之间可能存在异物摩擦导致异响，或者刹车片由于设计不合理造成的异响问题。在这种情况下，建议检查刹车系统，去除异物或更换合理的刹车片。此外，还要注意刹车盘是否已经磨损严重或变形等情况，并及时处理或更换。

以上是一些可能的原因及处理方式，但需要提醒的是具体故障原因需通过专业技术人员进行详细诊断，在不确定原因的情况下最好不要轻易处理，以免造成不必要的损失或安全隐患。建议及时联系汽车维修专业人员进行检查和维修。